此後,邪帝為了彌補愧疚,決心救醒昏迷的問菜,於是駕駛女媧星槎,強行闖入各地大小武林門派或世家門閥的領地,索要各種珍貴藥物,又綁架名醫上船,替問菜醫治。
這些武林門派或世家門閥,當然不肯乖乖就範。但只要稍有反抗,牛郎、大祭司等高手,便立刻大開殺戒。於是數月之內,殺得屍山血海,血流成河。正邪兩道,皆因此陷入最深沉的絕望和恐慌之中。大羅剎宗主則在這段時間裡,閉關修煉噬魂誅仙棍法,為再戰邪帝而作準備。
南宮問天既手執天晶,自然成為了正道最後的希望。於是南宮問天在二房的南宮飄等人協助下,吞併了東方世家。又得倖存的武林人士擁戴,登上武林盟主大位。成為對抗邪帝的最後希望。
另一方面,北冥雪不忍心武林陷入屍山血海,拿著新生神農尺,親自找上了邪帝。可是神農尺也完全救不了昏迷的問菜,邪帝傷心失望之下,竟連北冥雪也想殺掉。
加上入魔之後,自稱「劍皇」的劍心,心生不忍,於是出劍相救。但雖有魔兵之助,修為也大大增長,劍心始終不敵刀劍合一神技,被邪帝殺得重傷。
此時牛郎在旁邊獻策,認為既然神農尺也治不好問菜,那麼或許可以用天晶一試。邪帝採納了牛郎的計策,把北冥雪放走,讓她回去通知問天,讓問天獻上天晶。否則的話,就要殺死鐵心。
北冥雪倉皇離開,臨行前卻被大祭司把一顆魔珠,暗地裡植入她體內,並且暗地裡施展了迷心咒。當北冥雪去到南宮世家,把消息告知問天之後,迷心咒自然發作。北冥雪和問天兩人情不自禁之下,發生了最親密的關係。魔珠也隨之進入問天的右手潛藏寄生。
萬萬沒想到,此舉竟誘發出不可測之禍患。原來,久遠之前,女媧娘娘受元祖天魔的魔氣感染,從自己心中,滋生一頭最強大的「異魔」。雖然女媧及時以天晶和異魔拼了個同歸於盡,但異魔的元神,卻已經潛藏於天晶綠珠之內。
一直以來,綠珠都寄生在問天左臂之中,並且牢牢壓制異魔,令其無法作惡。但北冥雪把魔珠植入問天右臂,魔氣刺激之下,異魔竟再次活動起來,並且占據了北冥雪的肉身,企圖殺死問天。
關鍵時刻,一名神秘女子殺出,救下了問天。原來她就是銀法王的私生女靈劍子。銀法王當日改邪歸正,企圖阻止邪帝的成人禮,卻因此失敗,和天晶子劍一起迷失於時空亂流中。好不容易回歸現實,卻發現自己的女兒靈劍子已經死去。於是銀法王把天晶子劍植入女兒體內,讓靈劍子得以復活。更因此,靈劍子承擔起了輔助問天除魔滅邪的大任。
靈劍子和問天合力之下,異魔北冥雪倉皇逃走。東方雄則聞聲趕來,含淚懇求問天救下鐵心。於是問天向武林發出通知。要在正月十五,在東海之濱的東方世家公開挑戰邪帝。解救南宮鐵心。
正月十五一戰尚未開始,武林中各處已經暗流洶湧。
燕王潛心修煉十方奇招有所成就,再度出山重掌大權。首先廢了牛郎一身武功,然後企圖前往提前擊殺問天,奪取天晶。
雙方糾纏間,誤闖鑄兵世家鐵壁銅牆。在鐵壁銅牆,燕王與自己妻子和兩名女兒重逢。卻又遇上死對頭滅鬼神。雙方交手下,燕王因為身有傷患不敵,激憤之下,催生了又一件魔兵「裂天破地」。問天則巧獲奇金息壤,成為對抗邪帝的利器。燕王則壯烈犧牲。
北冥雪修為太低,不是一個好的操縱利用對象。異魔改為企圖依附在邪帝身上。邪帝雖然本是天魔一口氣,卻無意釋放天魔,拒絕再被利用,反過來企圖消滅異魔。異魔而不果,於是強行控制了鐵心,藉助鐵心的身體,逃離女媧星槎。
但鐵心內心良知未泯,異魔認為她始終不是一個好的合作對象,於是又放棄了她,改為找上被燕王廢功的牛郎,蛻變為「異魔-牛郎」。
百年前神道盟餘孽再現,圖謀報復邪帝和武林中各大門派。曾經在泰山奪刀一役中出現過的狂王再度現身,趁著邪帝不在的機會,搶走了魔兵帝恨和問菜。導致邪帝更加瘋狂。
同時,神道盟又分別搶走了魔兵龍刃、神兵十方俱滅,魔兵無妄等武器。把東方雄、火鳳凰、卓不凡、鐵心等人分別囚禁起來。
正月十五,東方海閣一戰。問天讓燕王的女兒假扮問菜,欺騙瘋狂的邪帝,然後從背後偷襲,重傷邪帝。然後又用奇金息壤封鎖邪帝。邪帝及時清醒,卻終於被封鎖了右臂,無法使劍。
混亂當中,神道盟人馬大舉進攻,魔兵龍刃因為和神兵鳳凰具有相同的力量,也能軟化息壤,解除封印。邪帝一個大意,竟然被砍斷了右臂。
因為斷臂而再度瘋狂的邪帝,強行以真氣操縱自己右臂,施展出刀劍合一的第二神技,橫掃全場。雖然有樂娃和西城秀樹攜新生的太虛和神舞兩大神兵前來救場,也無濟於事。
此時,女媧星槎、天晶、靈劍子、神舞等諸多和女媧有關的力量,聯手出擊,終於重創邪帝。邪帝再被息壤封鎖,沉下大海。
但此時,宗主卻和鐵心聯手,奮不顧身地前往搶救邪帝。問天等人精疲力竭,也無力再作追擊,刺邪一戰,就此落下帷幕。
之後,神道盟眾人主持「大審判日」,要向當年曾迫害神道盟的武林門派進行大報復。養好傷勢的問天回來,和西城秀樹、樂娃等裡應外合救人。神道盟眾人陷入絕境,於是把心一橫,引爆炸藥,炸毀神道堡。
問天以女媧星槎救走被囚禁的一眾武林人士。神道盟眾人則把身上所有內力全部灌輸給狂王,叮囑他記得為自己報仇,然後與爆炸的神道堡一起,沉入冰海。
另一方面,滅鬼神重新當上天地盟的盟主,但其父親滅穹蒼回歸,滅鬼神驚覺原來自己一直都被父親欺騙了,於是與之發生衝突,催生出又一件魔兵「悲怒權杖」。最後,滅鬼神和滅蒼生兩兄弟失望離開。與父親徹底決裂。
滅鬼神欲展開新生,於是來到杜康鎮,找到滅蒼生的師父「病出膏肓」,企圖醫治當年與宗主交手時,身中天神兵「天誅」一箭所留下的箭傷。
同時,宗主和鐵心也已經找到了被息壤封鎖的邪帝,並且以魔兵龍刃解除息壤封鎖,讓邪帝恢復自由。為了治療邪帝的手臂,再加上要治療武勇身上的廿七大限,於是他們也找上了隱居在杜康鎮的「病出膏肓」。
那邊廂,燕王竟離奇復活。原來先前他只是假死。在上天下地至尊功的幫助下,陷入假死,冰封自身以作自療。治療結束之後,修為大大提升,卻再無爭霸雄心,只以除魔救世為己志。
除魔救世,這個魔,就是異魔牛郎。它當日強行依附在鐵心身上,接觸了魔兵無妄,得到「模仿」和「學習」的異能。可以透過接觸不同的魔兵,學習不同的異能。當十大魔兵的異能盡數集於一身以後,就能破除天網,令困於網中的元祖天魔得以復活。
杜康鎮上,病出膏肓在宗主幫助下,治好了滅鬼神的天誅箭傷。然後邪帝為了報答解封之恩,也協助宗主,一起替武勇進行換血,以治療廿七大限。
把神道盟所有人功力全部集於一體的狂王,恰好在這時候找上門來。鐵心出手拒敵,率先敗退。滅鬼神再出手,慘死於魔兵帝恨刀下。但總算拖延到足夠時間,讓換血治療順利成功。因為失血過多,宗主和邪帝選擇聯手對敵,終於徹底擊殺了狂王。
神道盟之事完畢。邪帝和宗主也各自分別。此時,距離宗主的廿七大限,已經不足半月光陰。於是雙方約定,十天之後的三月初一,在一水隔天這個地方,進行一場「巔峰決戰」。以此印證武學至高境界。
天地盟方面。滅穹蒼決心重振聲威,和正道武林盟主南宮問天來一場大戰,決定誰是武林至尊。但因為赤蓋四陽功專注於火勁,長久修煉,五行失調,心臟負荷太重。全力運功的話,隨時有爆心之危。
異魔牛郎找上滅穹蒼,輸入魔氣保住他的心脈,企圖借刀殺人。然後又把北冥雪擄走。但滅穹蒼反而因此看破功名,不再執著於權欲。他把天地盟交託給問天,自己孤身離開,前往追殺異魔牛郎。卻和徒弟燕王不謀而合了。或許,這就是修煉上天下地至尊功的伏羲傳人之宿命。
在滅穹蒼和燕王看來,異魔牛郎是最嚴重的威脅。但在武林盟主南宮問天看來,曾經屠戮天下的邪帝,才是最重大的威脅。所以,雖然妻子北冥雪被異魔牛郎擄走,但南宮問天仍然選擇了前往一水隔天,觀看宗主與邪帝的巔峰決戰。
東方雄和火鳳凰因為關心鐵心,所以也強烈要求乘上星槎,跟隨問天前來一水隔天。但等待了這麼久,邪帝仍不見蹤影。和邪帝一起的鐵心也同樣不知所蹤。這如何不令東方雄和火鳳凰二人,深感擔憂了?